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武漢植物園完成亞洲的芒苞草屬和非洲的黑炭木屬植物葉綠體基因組比較與系統(tǒng)定位研究

發(fā)表日期:2021-06-21來(lái)源:武漢植物園放大 縮小

  翡若翠科(Velloziaceae)是由5屬約250個(gè)物種組成的單子葉植物科,在非洲大陸、馬達(dá)加斯加、阿拉伯半島、中國(guó)和南美洲間斷分布。該科植物多為耐旱的復(fù)蘇植物,因?yàn)榛ǖ奶卣鞣浅O嗨?,而葉形、植株大小和生活型等形態(tài)特征又具極大變異,因此,該科植物的分類(lèi)比較困難,成員之間的親緣關(guān)系仍然不十分清楚。

  中國(guó)科學(xué)院武漢植物園東非植物區(qū)系與分類(lèi)學(xué)科組對(duì)采自我國(guó)橫斷山區(qū)的芒苞草的葉綠體全基因組進(jìn)行了分析,并與兩個(gè)產(chǎn)自非洲的黑炭木屬植物Xerophyta spekeiX. viscosa進(jìn)行了葉綠體全基因組序列和形態(tài)上的比較研究。研究結(jié)果顯示,芒苞草和黑炭木屬的Xerophyta spekeiX. viscosa的葉綠體基因組全長(zhǎng)分別為153,843 bp,155,235 bp155,498 bp。葉綠體基因組由反向重復(fù)區(qū)(IRS)(IRaIRb)、大單拷貝區(qū)(LSC)及小單拷貝(SSC)區(qū)組成,上述三個(gè)物種的反向重復(fù)區(qū)序列長(zhǎng)度在27,022 bp27,110 bp之間,大單拷貝區(qū)(LSC)長(zhǎng)度在81,919 bp83,813 bp之間,小單拷貝(SSC)區(qū)長(zhǎng)度在17,387 bp17,880 bp之間。利用葉綠體基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,芒苞草是翡若翠科其余物種的姊妹群,是該科較早分化出來(lái)的物種(圖1)。分析結(jié)果強(qiáng)烈支持芒苞草與非洲翡若翠科的類(lèi)群聚為一支,表明芒苞草與翡若翠科其他類(lèi)群的近緣關(guān)系。

  研究成果以 “Complete Chloroplast Genomes of Acanthochlamys bracteata (China) and Xerophyta (Africa) (Velloziaceae): Comparative Genomics and Phylogenomic Placement” 為題,發(fā)表在國(guó)際植物學(xué)期刊Frontiers in Plant Science, 本項(xiàng)工作得到了中國(guó)科學(xué)院國(guó)際合作計(jì)劃項(xiàng)目(151853KYSB20190027)、中國(guó)科學(xué)院中-非聯(lián)合研究中心項(xiàng)目(SAJC202101)和中國(guó)科學(xué)院大學(xué)博士生獎(jiǎng)學(xué)金項(xiàng)目ANSO青年人才獎(jiǎng)學(xué)金的資助。

  研究生(留學(xué)生) Vincent Okelo Wanga和研究生董翔為共同第一作者。胡光萬(wàn)研究員為通訊作者。課題組多名學(xué)生參與了此項(xiàng)研究。 

  論文鏈接:doi: 10.3389/fpls.2021.691833  

 

  

1. 基于葉綠體基因組共有的59個(gè)單拷貝基因重建的翡若翠科3個(gè)物種的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。(A)最大似然樹(shù)(ML)(分支上示自舉值);(B)貝葉斯樹(shù)(BI)(分支上示后驗(yàn)概率)。

2. Xerophyta spekei Baker(由胡光萬(wàn)研究員攝于肯尼亞Chyulu山)

 

3. Acanthochlamys bracteata P.C. Kao  

    圖片來(lái)源:哈佛大學(xué)標(biāo)本館(FOC提供) http://www.efloras.org/florataxon.aspx?flora_id=2&taxon_id=100088) 

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