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工作動態(tài)

水生所研究揭示生物結(jié)皮微生物群落碳循環(huán)機制

發(fā)表日期:2022-06-02王瓊,李華來源:水生生物研究所放大 縮小

  土壤有機碳是地球表層陸地生態(tài)系統(tǒng)最大的碳庫,其動態(tài)平衡不僅反映了生物群落組成和生態(tài)功能的變化,也深刻影響了生物圈溫室氣體的排放和氣候變化過程。在當前全球溫室效應日益顯著的背景下,土壤碳庫研究逐漸成為了生態(tài)學領域關注的重點。土壤微生物是驅(qū)動土壤碳轉(zhuǎn)化的關鍵類群,盡管宏組學技術可通過基因豐度來預測物質(zhì)循環(huán)過程,但受制于微生物生理狀態(tài)、土壤有機質(zhì)化學結(jié)構(gòu)類型、有機碳氧化還原狀態(tài)差異等復雜因素的影響,在微生物群落水平上開展土壤碳循環(huán)格局及過程的研究始終是一個難題。 

  在超過全球陸地面積40%的干旱區(qū),由藍藻、地衣、苔蘚等隱花植物支撐的生物結(jié)皮群落(Biocrusts)分布廣泛。它們不僅能防風固沙、成土培肥,還能促進荒漠生態(tài)系統(tǒng)生物群落的發(fā)育演替,其特征明顯的初生演替過程是利用宏組學手段開展土壤生物群落研究的理想模式材料。中國科學院水生生物研究所胡春香研究員團隊在前期多年研究工作基礎上,對典型野外樣地不同演替階段的生物結(jié)皮(藻結(jié)皮、藍藻地衣結(jié)皮、綠藻地衣結(jié)皮和蘚結(jié)皮)開展了連續(xù)四年五批次的采樣調(diào)查工作,運用多種宏基因組技術及大數(shù)據(jù)模型分析手段,結(jié)合生理層面的酶活性測定和環(huán)境因子關聯(lián)分析,揭示了生物結(jié)皮群落微生物碳循環(huán)格局及其互作和調(diào)節(jié)機理。相關研究成果以“Carbon cycle in the microbial ecosystems of biological soil crusts”為題,近日在線發(fā)表于學術期刊Soil Biology and BiochemistryDOI: 10.1016/j.soilbio.2022.108729)。 

  宏基因組的測序分析結(jié)果表明,耗能的光能驅(qū)動的無機碳(Inorganic Carbon, IC)固定基因豐度較低,經(jīng)濟的化能驅(qū)動的高分子有機碳降解、發(fā)酵、需氧呼吸和CO氧化基因較豐富。在有機碳的分解過程中,初期淀粉/糖原和纖維素的降解相關基因豐度更高,末期發(fā)酵相關基因的豐度更高。結(jié)合絕對定量的GeoChip分析及關鍵酶活性測定,發(fā)現(xiàn)在演替過程中無機碳固定、發(fā)酵、CH4氧化、淀粉/糖原和肽聚糖降解過程均呈下降趨勢,多個高效的IC固定途徑及CO氧化和大多類型的有機碳降解呈增加趨勢。共現(xiàn)分析進一步表明,生物結(jié)皮生態(tài)系統(tǒng)中的碳循環(huán)由類似于初級生產(chǎn)的同化模塊和類似于次級生產(chǎn)的異化模塊組成;隨演替,循環(huán)途徑與微生物群落組成之間的關系發(fā)生著動態(tài)變化,兩個模塊通過CBB循環(huán)、乙醇和丙酸發(fā)酵連接在一起,并被干旱度和鹽度平衡。以上研究結(jié)果深化了對生物結(jié)皮演替過程中碳循環(huán)途徑和調(diào)控機制的理解,并為深入揭示氣候變化條件下全球干旱區(qū)碳庫平衡動態(tài)提供了研究基礎。 

  水生所王瓊博士為本論文第一作者、胡春香研究員為論文通訊作者,水生所張承才研究員、武漢理工大學張德祿教授參與了該項研究工作。該研究得到了國家自然科學基金(41877339)、中科院先導A項目(XDA17010502)及中科院特色研究所服務項目(Y85Z061601)的資助。

    文章鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071722001869 

1. 生物結(jié)皮群落中碳循環(huán)概念模型

2. 基于宏基因組測序的生物結(jié)皮的碳循環(huán);(aPCAPERMANOVA結(jié)果;(b)碳循環(huán)基因和途徑的相對豐度;右側(cè)分別為各無機碳固定(c)、CO氧化(d)、胞內(nèi)復雜有機碳的降解(e)、胞外復雜有機碳降解(f)以及各發(fā)酵(g)途徑的相對豐度;A、C、GM分別代表處于不同演替階段的四類生物結(jié)皮

3. 基于GeoChip分析的關鍵基因或酶標準化平均信號強度;(a)無機碳固定、甲烷代謝以及CO氧化過程;(b)有機碳降解過程

4. 碳循環(huán)關鍵基因與屬水平高豐度微生物的共現(xiàn)性網(wǎng)絡

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