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水生所合作揭示雀鱔目魚(yú)類的系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)與生物地理學(xué)過(guò)程

發(fā)表日期:2022-12-22楊連東來(lái)源:水生生物研究所放大 縮小

   

1 基于基因組數(shù)據(jù)和化石證據(jù)的雀鱔目魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育與生物地理學(xué)過(guò)程 

  魚(yú)類由于受到水系變遷的影響,其物種分化及地理分布格局與地球演化歷史密切相關(guān),整合現(xiàn)生魚(yú)類物種的分子數(shù)據(jù)與滅絕的化石記錄能夠?yàn)榈厍驓v史演變過(guò)程提供生物學(xué)證據(jù)。但是,大部分現(xiàn)生魚(yú)類是在晚中生代和新生代出現(xiàn)的,只有少部分現(xiàn)生魚(yú)類的物種分化時(shí)間可以追溯到中生代。雀鱔目魚(yú)類是起源年代久遠(yuǎn),并存活至今的一個(gè)類群,其化石記錄可以追溯到15千萬(wàn)年前的地層中,因此,雀鱔目魚(yú)類的物種分化可以很好地用于揭示地球演化歷史和水系變遷。

  中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員團(tuán)隊(duì)與耶魯大學(xué)Thomas Near教授團(tuán)隊(duì)合作,對(duì)雀鱔目所有7個(gè)物種進(jìn)行低覆蓋度基因組測(cè)序,基于鑒定到的1105個(gè)直系同源基因,并結(jié)合大量化石記錄,系統(tǒng)分析了雀鱔目魚(yú)類的物種分化及其生物地理學(xué)過(guò)程(圖1)。研究發(fā)現(xiàn):1)雀鱔目雀鱔科的2個(gè)現(xiàn)生屬,大雀鱔屬和雀鱔屬,是在1億年前發(fā)生分化;2)雀鱔目各類群的分化時(shí)間完美重現(xiàn)了中生代的重大地質(zhì)構(gòu)造事件,包括美洲大陸的形成,早期大西洋的擴(kuò)張,以及白堊紀(jì)北美大陸河流的構(gòu)造等;3)大雀鱔屬的冠群(crown clade)和雀鱔屬起源于新生代的北美洲東部,表明北美洲東部既是現(xiàn)生雀鱔的起源地,也是這一古老類群的避難所。

  該研究工作以“Phylogenomics of the Ancient and Species-Depauperate Gars Tracks 150 Million Years of Continental Fragmentation in the Northern Hemisphere”為題,在線發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Systematic Biologyhttps://academic.oup.com/sysbio/advance-article-abstract/doi/10.1093/sysbio/syac080/6946847?redirectedFrom=fulltext),水生所楊連東副研究員為共同通訊作者。該研究得到了中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)專項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金、中科院青促會(huì)和湖北省青年拔尖人才培養(yǎng)計(jì)劃的資助。

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