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工作動(dòng)態(tài)

水生所與蘭州大學(xué)合作發(fā)現(xiàn)生活方式和運(yùn)動(dòng)能力是影響兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化的主要因素

發(fā)表日期:2023-10-13鄒紅來源:水生生物研究所放大 縮小

  兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物是指體形上呈兩側(cè)對(duì)稱的動(dòng)物,其所包含的群體非常龐大。其中,至少有25個(gè)門的動(dòng)物已有線粒體基因組數(shù)據(jù),其中的7個(gè)門中包含寄生動(dòng)物。它們的線粒體是細(xì)胞的能量工廠,擁有獨(dú)立的遺傳物質(zhì)和體系,絕大多數(shù)還有與細(xì)菌類似的環(huán)形基因組。兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物的線粒體基因組通常包含13個(gè)蛋白編碼基因、2個(gè)rRNA基因和22個(gè)tRNA基因。已有研究報(bào)道,線粒體基因組的進(jìn)化速率在不同動(dòng)物類群中有明顯差異,如一些寄生動(dòng)物的進(jìn)化速率明顯快于自由生活動(dòng)物Dowton et al., 1995; Hassanin, 2006; Jakovli? et al., 2021; Shao et al., 2007; Shao et al., 2003。然而,并不是所有動(dòng)物都遵循這一規(guī)律,一些寄生動(dòng)物如寄生蜂的進(jìn)化速率較慢Castro et al., 2002,而一些自由生活動(dòng)物如土壤線蟲的進(jìn)化速率較快Bernt et al., 2013。這表明,寄生、自由生活等生活方式對(duì)線粒體基因組進(jìn)化速率的影響并不如想象中簡(jiǎn)單直接,可能涉及多種復(fù)雜的驅(qū)動(dòng)因素。另外,已有的研究結(jié)論大多是基于節(jié)肢動(dòng)物提出的,還亟需更深入(考慮生活方式以外的因素)和更全面(涵蓋其它主要的動(dòng)物類群)的研究來探究驅(qū)動(dòng)動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化的主要因素。 

  針對(duì)上述科學(xué)問題,109日,蘭州大學(xué)/西藏大學(xué)張東課題組、中國科學(xué)院水生生物研究所(以下簡(jiǎn)稱水生所)王桂堂學(xué)科組合作在國際知名學(xué)術(shù)期刊Nature Communications在線發(fā)表了題為“Mitogenomic evolutionary rates in Bilateria are influenced by parasitic lifestyle and locomotory capacity”的研究論文,揭示生活方式和運(yùn)動(dòng)能力是影響兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化的主要因素。 

  張東(2020年畢業(yè)于水生所,師從王桂堂研究員)和Ivan Jakovli?2011年畢業(yè)于水生所,師從桂建芳院士),一直致力于魚類寄生蟲的分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育研究,與王桂堂團(tuán)隊(duì)合作先后測(cè)定并發(fā)表了30多種魚類寄生蟲的線粒體基因組。團(tuán)隊(duì)的前期研究除發(fā)現(xiàn)扁形動(dòng)物、線蟲等寄生蟲的進(jìn)化速率較快以外Zhang et al., 2019; Zhang et al., 2019; Zou et al., 2017,還發(fā)現(xiàn)甲殼動(dòng)物的運(yùn)動(dòng)能力顯著影響其線粒體基因組的進(jìn)化速率Jakovli? et al., 2021。運(yùn)動(dòng)需要耗能,與線粒體功能密切相關(guān),不同運(yùn)動(dòng)能力水平可能導(dǎo)致動(dòng)物的線粒體基因組受到不同程度的選擇壓力,從而影響其進(jìn)化速率。除甲殼動(dòng)物外,軟體動(dòng)物Sun et al., 2017、昆蟲Mitterboeck et al., 2013、鳥類和哺乳動(dòng)物Shen et al., 2009等也曾發(fā)現(xiàn)過類似現(xiàn)象。運(yùn)動(dòng)能力也許可為上述科學(xué)問題提供合理解釋:運(yùn)動(dòng)能力強(qiáng)的寄生蟲如寄生蜂可能會(huì)受到較強(qiáng)的選擇壓力,導(dǎo)致進(jìn)化速率較慢;而運(yùn)動(dòng)能力弱的自由生活土壤線蟲可能受到松弛的選擇壓力,導(dǎo)致進(jìn)化加快。 

  為了系統(tǒng)探究生活方式(體內(nèi)寄生、體外寄生、擬寄生、微型捕食和自由生活5類)和運(yùn)動(dòng)能力(強(qiáng)、中、弱3類)對(duì)兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化速率的影響,研究團(tuán)隊(duì)比較分析了約11000種兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物的線粒體基因組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)不同類型兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物的進(jìn)化速率由高到低分別為:體內(nèi)寄生動(dòng)物>弱運(yùn)動(dòng)能力的體外寄生動(dòng)物>弱運(yùn)動(dòng)能力的自由生活動(dòng)物>擬寄生動(dòng)物>強(qiáng)運(yùn)動(dòng)能力的體外寄生動(dòng)物>微型捕食者和強(qiáng)運(yùn)動(dòng)能力的自由生活動(dòng)物。生活方式和運(yùn)動(dòng)能力是影響兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化的主要因素:生活方式可解釋45%的兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物進(jìn)化速率變異,運(yùn)動(dòng)能力可解釋39%的進(jìn)化速率變異,二者共同可解釋56%的進(jìn)化速率變異。運(yùn)動(dòng)能力對(duì)兩側(cè)對(duì)稱動(dòng)物線粒體基因組進(jìn)化的影響程度略小于生活方式,說明除了降低運(yùn)動(dòng)能力這個(gè)主要途徑外,寄生生活還可通過多種其它途徑來影響動(dòng)物的線粒體基因組進(jìn)化,如寄生蟲的代謝依賴導(dǎo)致的松弛選擇壓力、寄生蟲與宿主的“軍備競(jìng)賽”驅(qū)動(dòng)的定向選擇、有效種群大小降低(頻繁的建立者效應(yīng)、高物種形成率等)導(dǎo)致的遺傳漂變?cè)黾拥取?/span> 

LHT:生活方式;LOC:運(yùn)動(dòng)能力;EndoP:體內(nèi)寄生;EctoP:體外寄生;Ec:蛻皮動(dòng)物;Lo:冠輪動(dòng)物 

  蘭州大學(xué)生態(tài)學(xué)院/西藏大學(xué)生態(tài)環(huán)境學(xué)院張東青年研究員為該論文的通訊作者,Ivan Jakovli?博士為第一作者。水生所鄒紅高級(jí)實(shí)驗(yàn)師、王桂堂研究員,蘭州大學(xué)生態(tài)學(xué)院張宏教授、劉向青年研究員、葉彤博士和碩士研究生相傳鈺為本研究的共同作者。本研究得到了國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金項(xiàng)目(32102840)、地區(qū)科學(xué)基金項(xiàng)目(32360927)、重點(diǎn)項(xiàng)目(32230109)、面上項(xiàng)目(31872604)、西藏自治區(qū)科技廳自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(XZ202301ZR0028G)和蘭州大學(xué)人才引進(jìn)啟動(dòng)經(jīng)費(fèi)(561120206)的支持。 

  原文鏈接: https://doi.org/10.1038/s41467-023-42095-8 

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