東亞是世界淡水魚類多樣性最豐富的地區(qū)之一，形成了以鯉科（參考《中國(guó)動(dòng)物志: 硬骨魚綱. 鯉形目》的分類系統(tǒng)）魚類為主體的獨(dú)特的魚類構(gòu)成。其中，一類被稱為“東亞鯉”的類群（約154種）最為特殊，它們占據(jù)了季風(fēng)區(qū)大量的生態(tài)空間，表現(xiàn)出對(duì)河流-湖泊生態(tài)系統(tǒng)的高度適應(yīng)。這些魚類不僅成為東亞國(guó)家淡水養(yǎng)殖的重要對(duì)象，如青、草、鰱、鳙、鳊、鲌、鲴、赤眼鱒等，還在世界各地的淡水水域中造成了嚴(yán)重的生態(tài)入侵。以往基于分子系統(tǒng)學(xué)的觀點(diǎn)認(rèn)為，東亞鯉是東亞季風(fēng)活動(dòng)的產(chǎn)物。然而，這些研究關(guān)于東亞鯉的進(jìn)化時(shí)間（如，推測(cè)的起源時(shí)間跨度從14.49到43.3百萬(wàn)年前不等）和進(jìn)化關(guān)系并沒(méi)有達(dá)成一致。因此，東亞鯉的起源和演化是否與東亞季風(fēng)相關(guān)仍需要評(píng)估。如果兩者有關(guān)系，在季風(fēng)的影響下，東亞鯉是如何形成當(dāng)前的分布模式的？支撐東亞鯉伴隨季風(fēng)演化的潛在因素是什么？為了理解這些問(wèn)題，研究人員從生態(tài)地理、系統(tǒng)發(fā)育、宏觀進(jìn)化和比較基因組等角度對(duì)東亞鯉進(jìn)行了系統(tǒng)地調(diào)查。

　　研究顯示：

圖3 東亞鯉的宏進(jìn)化分析。（A）成種速率分析，紫色表示“河-湖”類群。（B）DTT分析顯示東亞鯉在季風(fēng)增強(qiáng)期有明顯的形態(tài)快速分化。（C）支系間的分化（黑色）和擴(kuò)散（紅色）事件也都在東亞季風(fēng)盛行期達(dá)到了最大。（D）東亞鯉的起源與擴(kuò)散，箭頭的粗細(xì)表示擴(kuò)散事件的強(qiáng)度。（E）各區(qū)域之間的物種擴(kuò)散，圓圈的面積表示支系分化事件發(fā)生的頻次。 

　　3、為何東亞鯉在季風(fēng)區(qū)表現(xiàn)出如此高的優(yōu)勢(shì)呢？基于比較基因組學(xué)的研究發(fā)現(xiàn)，東亞鯉群體中與大腦等神經(jīng)系統(tǒng)功能相關(guān)的基因（包括環(huán)境感知和驚嚇?lè)磻?yīng)維持等）在調(diào)控區(qū)存在大量的變異。這些遺傳變異是所有東亞鯉共享而其它鯉科魚類中沒(méi)有的，涵蓋大量新出現(xiàn)的調(diào)控元件和保守元件的大片段特異突變。這意味著東亞鯉在腦等神經(jīng)系統(tǒng)的調(diào)控層面發(fā)生了一些獨(dú)特的改變。事實(shí)上東亞鯉也確實(shí)比其它鯉科魚類表現(xiàn)得更活躍、更敏感。因此，研究人員推測(cè)這些涉及大腦等神經(jīng)調(diào)控層面的“創(chuàng)新”可能有助于東亞鯉更好地應(yīng)對(duì)季風(fēng)區(qū)水體環(huán)境的季節(jié)性變化。 

　　4、此外，研究人員還發(fā)現(xiàn)東亞鯉成員間存在十分普遍的基因流，這些基因流事件多發(fā)生于的古老的演化支系間。因此，研究人員推測(cè)這些古老的基因流也可能參與了東亞鯉的輻射。