“萬(wàn)種原生生物基因組計(jì)劃（P10K）”的標(biāo)志。設(shè)計(jì)思路：標(biāo)志由不同原生生物組成。其中鐘蟲（纖毛蟲）代表字母“P”，裸藻（鞭毛蟲）和團(tuán)藻（綠藻）的組合代表數(shù)字“10”，阿米巴代表字母“K”。雙螺旋既代表DNA又代表水波，即原生生物生存的水環(huán)境。“P”中噴發(fā)出諸多原生生物，代表1676年列文虎克發(fā)現(xiàn)鐘蟲之后，高度多樣的各種原生生物被發(fā)現(xiàn)。

　　近日，由中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所及北京基因組研究所（國(guó)家生物信息中心）聯(lián)合發(fā)布了P10K第一批數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)通過(guò)萬(wàn)種原生生物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（P10K database，https://ngdc.cncb.ac.cn/p10k/）共享發(fā)布釋放，相關(guān)論文以“The P10K database: a data portal for the protist 10000 genomes project”為題發(fā)表于Nucleic Acids Research。P10K第一批數(shù)據(jù)共收錄了2959個(gè)原生生物數(shù)據(jù)集，包括1601個(gè)基因組和1358個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集，覆蓋了原生生物75%的綱和45%的目。其中，從公共數(shù)據(jù)庫(kù)整合了1858個(gè)數(shù)據(jù)集，P10K團(tuán)隊(duì)新測(cè)序了1101個(gè)數(shù)據(jù)集，以原生動(dòng)物纖毛蟲（Ciliate）為主。新測(cè)序數(shù)據(jù)將原生生物數(shù)據(jù)集規(guī)模整體提升了37%。新測(cè)序的樣品由P10K團(tuán)隊(duì)從國(guó)內(nèi)多種生境中采集、分離。對(duì)于不能實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的絕大部分原生動(dòng)物，采用了單細(xì)胞測(cè)序方法，占新測(cè)序數(shù)據(jù)的98%。同時(shí)，為了解決大規(guī)模單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)的分析問(wèn)題，P10K團(tuán)隊(duì)研發(fā)了一套針對(duì)原生生物單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的組裝、去污染、物種鑒定、基因注釋和評(píng)估的標(biāo)準(zhǔn)化分析流程。質(zhì)量評(píng)估顯示，該流程注釋的基因組與公共數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)布的基因組具有相似比例的中高等質(zhì)量數(shù)據(jù)。