武漢植物園完成東非葫蘆完整葉綠體基因組解析,科研進(jìn)展,中國(guó)科學(xué)院武漢分院,中國(guó)科學(xué)院">
     首頁(yè) >> 新聞 >> 科研進(jìn)展

科研進(jìn)展

武漢植物園完成東非葫蘆完整葉綠體基因組解析

發(fā)表日期:2025-04-21來(lái)源:武漢植物園放大 縮小
葫蘆科(Cucurbitaceae)作為被子植物中重要的經(jīng)濟(jì)類群,包含95屬900余種植物,其中瓜類作物具有重要的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)價(jià)值。葫蘆屬(Lagenaria)為該科的代表性屬,共包含6個(gè)物種,但僅有葫蘆(Lagenaria siceraria)被廣泛栽培利用。葫蘆屬的東非葫蘆(Lagenaria abyssinica)因其藥用價(jià)值和作為傳統(tǒng)容器的實(shí)用功能而備受關(guān)注。然而,該物種的遺傳信息尚未見報(bào)道,這嚴(yán)重制約了對(duì)其系統(tǒng)進(jìn)化地位以及種質(zhì)資源利用等方面的深入研究。
近期,中國(guó)科學(xué)院武漢植物園東非植物區(qū)系與分類學(xué)科組與湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物分類學(xué)研究團(tuán)隊(duì)合作,成功解析了東非葫蘆葉綠體全基因組序列。該研究首次完成了東非葫蘆葉綠體基因組的測(cè)序與精確注釋,不僅填補(bǔ)了這一重要野生種質(zhì)資源的分子數(shù)據(jù)空白,更為葫蘆科植物的系統(tǒng)發(fā)育重建、進(jìn)化機(jī)制解析以及藥用資源開發(fā)利用提供了重要的分子生物學(xué)基礎(chǔ)。
研究顯示,東非葫蘆的葉綠體基因組全長(zhǎng)為156, 800 bp,為典型的環(huán)狀四分體結(jié)構(gòu)。通過比較分析,研究人員發(fā)現(xiàn)了20個(gè)高度變異的基因位點(diǎn),或可作為潛在的DNA條形碼用于物種鑒定。該項(xiàng)研究還鑒定出32個(gè)正選擇的基因,這些基因可能在東非葫蘆適應(yīng)特定環(huán)境的過程中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。利用新獲得的葉綠體基因組數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊(duì)對(duì)東非葫蘆的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了梳理。分析結(jié)果顯示,東非葫蘆與葫蘆具有較近的親緣關(guān)系,葫蘆屬與西瓜屬(Citrullus)為姐妹類群。
研究成果以“The complete chloroplast genome of Lagenaria abyssinica (Hook.f.) C. Jeffrey: comparative and phylogenetic analysis”為題,在國(guó)際植物學(xué)期刊Genetic Resources and Crop Evolution上發(fā)表。武漢植物園與湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)的碩士研究生許海霞為第一作者,湖南師范大學(xué)譚英講師、蔡秀珍副教授及武漢植物園胡光萬(wàn)研究員為共同通訊作者。
這項(xiàng)研究得到了湖北省科學(xué)技術(shù)創(chuàng)新人才與服務(wù)計(jì)劃(2022EHB031),國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(32270228),中國(guó)科學(xué)院中-非聯(lián)合研究中心項(xiàng)目(SAJC202401)的支持。

圖1 東非葫蘆與其他葫蘆科物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系


附件: